1、《条例》及《细则》规定：购进固定资产取得增值税发票可以抵扣销项税额，但购进用于非应税项目、免税项目、集体福利或者个人消费（包括纳税人的交际应酬消费和自用的应征消费税的摩托车、小汽车、游艇）的固定资产（含混用的机器设备）及属于营业税应税项目的不动产以及发生的不动产在建工程（包括新建、改建、扩建、修缮、装饰不动产的原料费和修理费）不允许抵扣进项税额。这是这次增值税转型改革的关键点。
2、《财政部、国家税务总局关于全国实施增值税转型改革若干问题的通知》（财税[2008]170号）根据新《条例》、《细则》针对固定资产进项税抵扣政策的有关规定作出了补充，即：从2009年1月1日起，增值税一般纳税人购进（包括接受捐赠、实物投资）或者自制（包括改扩建、安装）固定资产发生的进项税额（简称固定资产进项税额），可凭增值税专用发票、海关进口增值税专用缴款书和运输费用结算单据（统称增值税扣税凭证）从销项税额中抵扣。
但应注意以下几点：
（1）允许抵扣的固定资产进项税额，是指纳税人2009年1月1日以后（含1月1日）实际发生，并取得2009年1月1日以后开具的增值税扣税凭证上注明的或者依据增值税扣税凭证计算的增值税税额。在2008年以前发生固定资产购进的，即使取得了2009年1月1日以后开具的增值税专用发票及相关业务的扣税凭证也不允许抵扣。
（2）自2009年1月1日起，纳税人销售自己使用过的固定资产（指纳税人根据财务会计制度已经计提折旧的固定资产），要区分不同情形征收增值税：
①销售自己使用过的2009年1月1日以后购进或者自制的固定资产，按照适用税率征收增值税。
②2008年12月31日以前未纳入扩大增值税抵扣范围试点的纳税人，销售自己使用过的2008年12月31日以前购进或者自制的固定资产，按照4%征收率减半征收增值税；
③2008年12月31日以前已纳入扩大增值税抵扣范围试点的纳税人，销售自己使用过的在本地区扩大增值税抵扣范围试点以前购进或者自制的固定资产，按照4%征收率减半征收增值税；销售自己使用过的在本地区扩大增值税抵扣范围试点以后购进或者自制的固定资产，按照适用税率征收增值税。
（3）纳税人已抵扣进项税额的固定资产用于非增值税应税项目、免征增值税项目、集体福利或者个人消费以及自制或购进固定资产发生非正常损失要在当月计算并转出不得抵扣的进项税额。
（4）纳税人发生固定资产视同销售行为，对已使用过的固定资产无法确定销售额的，以固定资产净值为销售额。
（5）自2009年1月1日起，进口设备增值税免税政策和外商投资企业采购国产设备增值税退税政策停止执行。原《财政部、国家税务总局关于印发〈东北地区扩大增值税抵扣范围若干问题的规定〉的通知》（财税[2004]156号）等15个扩大增值税抵扣范围试点的政策文件从2009年1月1日起停止执行。
3、因购置机器设备的进项税可以抵扣销项税额，所以新《条例》删除了原《条例》“来料加工、来件装配和补偿贸易所需进口的设备”免征增值税政策。
（二）明确了与固定资产进项税抵扣政策相关的进项税额抵扣政策。
1、将不允许抵扣进项税货物的运输费用和销售免税货物运输费用的进项税额列入了不得从销项税额中抵扣的范围。即：不允许抵扣进项税的项目，其包含的运输费用的进项税额也不得抵扣。
2、将购进货物发生非正常损失（包括被盗、丢失、霉烂变质）时，与其购进相关的劳务进项税额也不得从销项税额的抵扣，如：与购进货物相关的运输费、加工修理费等。
