首先这里应为同等学力，而非学历。二者并无本质上的区别，含金量是一样的，但是在以下几方面有细微差别：
1.从上课学习时间来讲：
全日制研究生是脱产全日制学习。同等学力申硕是利用非工作时间，比如周末时间进行学习。常见的有周末班、集中班和网络班。
2.从录取制度来讲：
全日制研究生需要参加每年12月份的全国硕士研究生统一入学考试(简称“统考”)，被录取后，获得研究生学籍。属于淘汰选拔制，择优录取。修满学分后获得硕士学位证书。
同等学力申硕指仍在原工作岗位承担一定工作任务同时进行非脱产学习的研究生，参加研究生课程班不需入学考试，学分修满者，可由办班院校发给研究生课程进修班结业证书。满足申硕条件者，通过研究生同等学历人员申请硕士学位全国统考，并通过学术论文答辩后，同样获得硕士学位。考试属于合格制，通过率高。
3.从获取的证书来讲：
全日制研究生最后能够获得硕士学位证书和毕业证书。同等学力申硕最后能够获得与统招研究生一模一样的硕士学位证书和结业证书。
4.从报考条件来讲：
全日制研究生是专科毕业2年，本科学历，已获硕士或博士学位的人；特殊专业要专科毕业5年，本科毕业3年，已经获得硕士或博士学位2年。
同等学力申硕专科学历可以参加研修班学习，不要求毕业年限，但参加申硕考试需要本科有学士学位，并且学士学位要获得满3年，或者有硕士、博士学位的人才能报名。
总的来说，同等学力申硕和全日制研究生主要有以上区别。
资料拓展：
申请研究生毕业同等学力硕士学位需要满足以下条件：
(一)已获得学士学位，并在获得学士学位后工作3年以上;或虽无学士学位但已获得硕士或博士学位;或通过教育部留学服务中心认证的国(境)外学士、硕士或博士学位获得者。
(二)申请人在教学、科研、专门技术、管理等方面有关材料已提交学位授予单位，并经学位授予单位审查确定具有申请硕士学位资格。
(三)根据《关于授予具有研究生毕业同等学力人员临床医学、口腔医学和中医硕士专业学位的试行办法》(学位〔2015〕10号)，以同等学力申请临床医学、口腔医学和中医硕士专业学位的考生资格不受本项第(一)款和第(二)款限制，但须具备以下条件：
1. 临床医学类、口腔医学类、中医学类、中西医结合类本科毕业生并获得学士学位;
2. 正在接受住院医师规范化培训的住院医师或已获得《住院医师规范化培训合格证书》的临床医师;
3. 申请人所申请的专业学位类别及领域应与住院医师规范化培训学科相对应。
学员成功申请硕士学位后，可以获得硕士研究生学位证书。
