万历年间当朝皇帝是：明神宗朱翊钧。（万历是明神宗朱翊钧的年号，明朝使用这个年号48年。）
大事记录：
1、万历六年：李时珍撰写《本草纲目》，本书为本草学集大成之作。达尔文(Chrles Robert Darwin)在其著作中亦多次引用本书的资料，并称之为“古代中国百科全书”。
2、万历十年，利玛窦来到中国传教利，玛窦是天主教在中国传教的最早开拓者之一，也是第一位阅读中国文学并对中国典籍进行钻研的西方学者。他传播西方天文、数学、地理等科学技术知识，他的著述对中西交流作出了重要贡献。
3、万历十二年，利玛窦绘制第一张中文世界地图《山海舆地图》，介绍天下有五大洲：亚细亚、欧罗巴、利未亚、亚墨利加、墨瓦腊泥加.这是中国人首次接触到了近代地理学知识。
4、万历十二年，朱载出版《律吕精义》，书中提出了“新法密率”。这是中国音乐史上一件具有划时代意义的事件，也成为人类文化史上最早出现的十二平均律数学理论。
5、万历二十九年，杨继洲撰写《针灸大成》，本书较全面论述针灸理论、操作手法等，并考定腧穴名称和部位，记述历代名家针灸医案，为对明以前针灸学术的又一总结，是学习研究针灸的重要参考著作。
当时的宰相：万历没有宰相，明洪武十三年（公元1380年），朱元璋为了加强中央集权，废丞相，罢中书省，设“四辅官”，不过当时的内阁首辅张居正就相当宰相，他辅佐万历皇帝朱翊钧开创了“万历新政”。
扩展资料：
万历（1573年9月4日－1620年8月18日）是明神宗朱翊钧的年号，明朝使用此年号共48年，为明朝所使用时间最长的年号。万历前期，张居正主导实行了一系列的改革措施，社会经济持续发展，对外军事也接连获胜，朝廷呈现中兴气象，史称万历中兴。
历史学家黄仁宇用“大历史观”的角度，写了《万历十五年》这本研究明史的专著。
明神宗在位前十年，由于年幼，由母亲李太后代为听政，太后则将一切军政大事交由张居正主持裁决，实行了一条鞭法等一系列改革措施，使社会经济很大的发展，是为“万历中兴”。
参考资料：百度百科-万历
