3个月一次签注和1年一次签注区别在于，前者只能在三个月以内的任意时间去香港一次，而后者可以在一年以内的任意时间，去香港一次。
港澳通行证签注的种类
3个月一次签注（签注的有效期是3个月，可3个月以内任何时间去一次香港）
3个月二次签注（签注的有效期是3个月，可3个月内可以去两次香港）
1年一次签注（签注的有效期是1年，可1年内任意时间去香港一次）
1年二次签注（签注的有效期是1年，可1年内任意时间去香港两次）
扩展资料：
港澳通行证办理流程：
1.填写《中国公民出入境申请表》；
2.申请表格必须用中性笔填写，字迹要端正、清楚，不能潦草或涂改；
3.表格一式一份，必须全部填写，且每项内容必须一致；
4.表格的右上角印有申请编号(四张表编号是一致的),申请人必须牢记，以便日后查询；
5.填写的资料必须与户口本或者身份证上的资料一致：
6.一般都是在出入境指定地方复印/照相，粘贴身份证复印件、户口本（首页、本人页）复印件，并将相片粘贴于审批表右上角。交予民警审核受理；
7.民警核对后无问题就算完成，记得留下工作人员电话方面查询护照是否已出.交费用200元就算完成。15个工作日就出来了，可选择邮寄工作地；
8.领取回执单和缴费单，保存好以便查询。
去港澳要办港澳签注：基本首次都是和港澳证一块办理的。
