以下是各种仓鼠的性别的分辨方法：
未断奶的仓鼠：
无论是侏儒仓鼠还是熊类仓鼠，5-17天左右，可以用是否能看见乳头分辨仓鼠性别。能看见乳头的就是母仓鼠，不能看见乳头的是公仓鼠。
成年的侏儒仓鼠 ：
侏儒仓鼠（一线类、公婆类、三线类）性别分辨方法都是一样的。肛门与生殖器官之间的距离比较近、有一条肉缝的是母仓鼠。另外有些鼠友误以为母的侏儒仓鼠是没香腺的，这是错误的，在图上面我们可以看见母的侏儒仓鼠也是有香腺的，只不过母的侏儒仓鼠香腺比较不明显（通常要5个月大以上才能看出一点香腺）。肛门与生殖器官之间的距离比较远、有毛的是公仓鼠。
成年的熊类仓鼠：
成年的熊类仓鼠性别很好分辨，主意还是看肛门与生殖器官的距离，距离很近的是母仓鼠。肛门与生殖器官之间的距离比较远、有毛的是公仓鼠。而且公的熊类仓鼠都有很大的蛋蛋（睾丸）。一般家养营养好的公熊，20几天大就能看见蛋蛋。
