1、开具企业类型不同
通用机打票是小规模纳税人开具的，增值税普通票是小规模纳税人和一般纳税人都可以开具的。通用机打票是适合于增值税的小规模纳税人使用，属于增值税普通发票的一种，但是发票的版式和增值税一般纳税人的增值税普通发票不同。
2、税率不一样
国税通用机打票是增值税率3%。增值税普通票增值税根据开具企业适用行业不同税率也不同。
3、金额含义不同
国税通用机打票只有金额没有税额，增值税普通票既有金额也有税额。
4、开票系统不同
通用机打发票使用的是开票软件，严格来讲不属于税控系统，常用于小规模纳税人。增值税普通发票，与增值税专用发票共一个税控系统，常用于一般纳税人。
参考资料来源：百度百科-增值税普通发票
参考资料来源：百度百科-发票
