一、农村自建房要办理土地使用证
1、土地证可以证明该土地面积归您享有，在遇到司法问题或强买强占时可以受到法律保护。每块需要建房的土地都是需要办理房屋土地使用证的，这样才能保障好您的权益。
2、土地来源分为很多种，比如农村机关单位划分房、福利分房等公房转私房的房子，在进行土地使用证时需要过户，过户必须按照农村当地的3%地价来付出让金。
所以农村自建房是要办理土地使用证的。
二、农村办理土地使用证程序
1、申请
（1）由农村村民个人向所属乡镇国土资源管理所提出申请，领取到土地登记申请审批表。
（2）提交个人身份证或农村居民户口簿复印件一份。
（3）土地权属材料(82年5月14日以前，提交村、队权属来源的证明书；82年的5月14日以后，提交农村建房的使用证；97年的4月以后提交农村建房申请书、农村建设用地批准书等)。
2、调查
由乡镇国土资源管理所对申请者的用地进行地籍调查、地籍测量、申请人现场指界、邻宗地签字盖章，填写地籍的调查表以及绘制出宗地草图。
3、审核
先由乡镇国土资源管理所进行审核，再报县国土资源局审核，审核用地的材料是否合法，用地界线是否没有争议，用地面积是否准确等等方面。
4、审批
经审核符合“用地面积清楚，界址也准确，权属是合法，没有争议”原则的，可以批准并进行张榜公布，在公布一个月以内无单位或个人对其提出争议的，由县人民政府颁发集体的土地使用证。
三、办理农村土地使用证所需要的资料
1、户主身份证复印件(一份)。
2、土地使用权登记申请表(一份)。
3、地籍调查界址确认表(一份)。
4、农村私人建房用地呈报表(已经政府批准的一份)。
5、土地使用登记表(一份)。
6、其他要求提供的证明资料。
