一、地区不同：
区级医保的医保卡只可以在本区医保定点医院刷卡治疗，而市级医保的医保卡可以在全市的医保定点医院刷卡治疗。
二、报销比例不同：
通常情况下区级医保报销比例比较高，而市级医保的报销比例就比区级医保低一些。
三、所属单位不同：
区级医保只能是本区直属单位的职工办理，而且档案要在区人才代理中心保管，还要办有养老统筹。那市级医保自然就是要市直属单位的职工才能办理，而且档案也相应的应该在市人才代理中心。
四、两个医保的定点医院不同：
区级医保的医保卡只能在区级定点医院刷卡治疗，市级的可以在整个地区刷卡治疗。报销比例不同，各地情况不一样，一般是区医保报销比例高于市医保。
参考资料来源：百度百科-医保
