蔷薇科分为以下四个亚科：
（1）绣线菊亚科SpiraeoideaeAgardh
灌木，稀草本，单叶稀复叶，叶片全缘或有锯齿,常不具托叶或稀具托叶；心皮1～5～12，离生或基部合生；子房上位，具2至多数悬垂胚珠；果实成熟时多为开裂的稀蒴果。染色体基数多为8或9。
本亚科中国有8属：绣线菊属、鲜卑花属、假升麻属（棣棠升麻属)、珍珠梅属、风箱果属、绣线梅属、野珠兰属（米空木属)、白鹃梅属。
（2）苹果亚科MaloideaeWeber
灌木或乔木，单叶或复叶，常有托叶；心皮1～2或2～5,多数与杯状花托内壁连合;子房下位、半下位，极稀上位，1～2或2～5室，各具2稀1至多数直立的胚珠；果实成熟时为肉质的梨果或浆果状，稀小核果状。染色体基数=17。
本亚科中国有16属：牛筋条属、栒子属、大棘属、山楂属、小石积属、红果树属、石楠属、枇杷属、石斑木属、花楸属、榅桲属、木瓜属、梨属、苹果属、唐棣属等。
（3）蔷薇亚科RosoideaeFocke
灌木或草本，复叶，稀单叶，常有托叶；心皮常多数，离生，各具1～2悬垂或直立胚珠；子房上位；果实成熟时为瘦果，着生在膨大肉质的花托内或在托上。染色体基数=7,8,9。
本亚科中国有20属：蔷薇属，绵刺属、龙芽草属、马蹄黄属、羽衣草属、地榆属、棣棠属、鸡麻属、蚊子草属(合叶子属)、悬钩子属（树梅属）、仙女木属（多瓣木属)、路边青属（水杨梅属)、无尾果属、林石草属、草莓属、蛇莓属、委陵菜属（金露梅属）、山莓草属（五蕊莓属）、地蔷薇属和在华北新发现的太行花属。
（4）李亚科PrunoideaeFocke
李亚科：乔木或灌木，单叶，有托叶；心皮1，极稀2～5，子房上位，1室内含2悬垂胚珠；果实为核果，成熟时肉质，多不裂开或极稀裂开，染色体基数=8。
本亚科中国有9属：扁核木属、臀果木属、臭樱属（假稠李属）、李属、桃属、杏属、樱桃属、稠李属等。
