按合同范本的格式，合同内容包括协议书、通用条款、专用条款和附件，在专用条款内还有补充条款的内容。因此，通用条款和合同协议书不是一回事。
协议书：是合同双方就工程项目达成的协议，主要内容包括：工期、价款、合同支付方式等。
通用条款：是根据法律、行政法规规定及建设工程施工的需要订立，通用于建设工程施工的条款。
专用条款：是发包人与承包人根据法律、行政法规规定，结合具体工程实际，经协商达成一致意见的条款，是对通用条款的具体化、补充或修改。
因此，通用条款是格式条款，不容许修改，但允许在专用条款中进行补充和修改。
按合同范本规定的解释顺序，合同协议书效力最高，其次是专用条款，最后是通用条款。
