当时，日本在德川家光的主持下已经开始实行锁国。
黄宗羲1649年曾与阮美、冯京第等人一起出使日本借兵，在《日本乞师记》中，他写道日本“销兵忘战”“粉饰隆平”“风俗侈汰”，因此根本无力出兵，结果导致了乞师无果而终。
郑成功也向日本借兵一直未获成功，可日本没有直接出兵，但也给了郑成功一些资助，比如郑成功第四次向日本借兵（1660年），日本就给了他一批火器和刀剑以供军用。
南明向日本借兵，也有着和美国要求“开港”类似的问题，从郑芝龙借兵写的8封求助信就能看出，他当时同时给天皇、将军和代表幕府统治长崎港的长崎奉行写信，殊不知，这是幕府最不希望看到的局面，如果国内意见不能统一，幕藩体制就可能遭受冲击，只是当时德川幕府实力尚强，诸大名不敢造次罢了。但郑芝龙之后，南明历次向日本借兵，还在犯同样的错误，他们有时找长崎奉行，有时找幕府，有时找天皇，甚至还有人去向萨摩藩求援，按照南明方面的理解，多方求助肯定比抱定幕府一棵树吊死好，但在幕府方面来看，南明却不断在给自己添乱子，因而只会把南明朝廷看作一个麻烦的存在。
日本不出兵支援南明有很多原因，最主要的是经历了大航海时代和文禄庆长之役后，日本人发现世界是多中心的（中国、欧洲、印度、日本都是中心），非以往观念中那种单中心（文化以中国为中心、宗教以印度为中心），日本人的世界观也随之变化，从原来将中国视为“华”，将自己视为“夷”，变成了把自己和中国同样视为“华”，因而认为日本的国运不再系于中国，也就无须为了防止中国出现“以夷变夏”倾尽全力。
