不会的，你已经把系统盘格式化了，在运行里面的镜像，怎么会中病毒呢？实在不放心的话，你可以把镜像放进其他盘里，解压，安装pe，进而安装系统
另外还有几个让U盘告别病毒的小方法：
一、开启读写保护
如果你只是将文件带去打印店打印，或者拷贝给朋友，那么避免中毒最好的办法就是在拔出U盘的时候拨动U盘的写保护开关，这样别人就只能读取U盘中的内容，而无法往里面放东西，这样病毒自然也无法往里面拷贝病毒文件了。
二、从原理上拒绝病毒写入文件
病毒通过U盘传播，其实是利用了Windows系统的“自动播放”功能，而使用“自动播放”功能，则必须要在盘符的根目录建立一个autorun.inf文件，利用autorun.inf文件引导系统的“自动播放”功能来读取预先设置的文件。既然autorun.inf文件那么重要，那么我们有没有办法不让病毒将autorun.inf文件写入到U盘中呢？办法肯定是有的，要对付病毒，我们唯有先下手为强。我们可以提前在U盘中建立一个autorun.inf文件，并且通过属性设置将这个autorun.inf文件设置为无法删除和更改，那么病毒不就拿你的U盘没辙了。
三、搜索存在漏洞的网站
方法很简单：点击“开始”菜单→“运行”，输入“cmd”运行“命令提示符”，假设U盘的盘符为“X：”，我们输入“X：”命令并回车，然手输入“mdautorun.inf”并回车，这样就创建了一个名字为“autorun.inf”的文件夹。接着再输入“attribautorun.inf+r+a+h+s”并回车，一个具有多项保护属性的autorun.inf就建成了。
四、关闭自动播放
追溯根源，从系统入手，上面我们已经提到，病毒通过U盘进行传播其实是利用了系统的“自动播放”功能，那么如果我们将“自动播放”功能关闭，不就可以让U盘病毒报废了吗？
关闭的方法为：点击“开始”→“运行”，输入“gpedit.msc”运行“组策略”，依次展开“计算机配置”→“管理模版”→“系统”，在右侧窗口可以找到“关闭自动播放”项，其状态为“未被配置”。双击之，在“策略”中选中“启用”选项，点击“确定”即可。
这样还不够，因为双击盘符后，autorun.inf还是会被激活的，彻底的解决办法就是让autorun.inf文件失效。点击“开始”菜单→“运行”，输入“regedit”运行“注册表编辑器”，定位到HKEY_CURRENT_USERSoftwareMicrosoftWindowsCurrentVersionExplorerMountPoints2处，在MountPoints2项上点右键→权限，在出现的权限面板中点击“添加”按钮，将“everyone”填写到“输入对象名称来选择”处，然后点击一下“检查名称”，再点击“确定”。回到权限面板，选中添加的“everyone”账户，在下方的“完全控制”中选择“拒绝”。最后点“确定”即可。
望采纳。
