北京协和医学院的本科专业是生物学、生物医学工程、临床医学、药学等是本科专业。
学校历经“私立北平协和医学院”、“中国协和医学院”、“中国首都医科大学”、“中国协和医科大学”等多个历史阶段，于2007年5月18日正式复名为北京协和医学院。
2006年9月5日，教育部、卫生部共建“北京协和医学院-清华大学医学部”大会暨揭牌仪式举行。北京协和医学院由中国教育部和卫生部双重领导，与中国医学科学院实行院校合一的管理体制。
2012年9月，首批入选国家级大学生创新创业训练计划。11月，入选教育部、卫生部第一批“卓越医生教育培养计划”项目试点高校。
多年来为国家培养了大批优秀的临床医学家、医学科学家、医学教育家、护理学家和医政管理学家，为我国医学教育、医学科学研究和医疗卫生事业的进步和发展做出了积极的贡献。
