1、西药治疗：用胃动力药增加胃肠道蠕动，抑制胆汁反流入胃，用胃粘膜保护剂保护胃黏膜免受胆汁损伤，用胃膜素覆盖胃黏膜以减轻反流的胆汁和胃酸对胃黏膜的刺激，以及用药物促使胃粘膜分泌粘液，促进炎症愈合等。
2、中药治疗：中医认为胆汁反流性胃炎是脾胃升降失调、水饮停滞胃脘，兼有肝气郁结引起，应对症下药配合饮食调养治疗。
3、手术治疗。
药物治疗
1.促胃动力药物：通过促进胃排空，减少胆汁在胃内的停留时间，促进反流物的排空。常用药物包括甲氧氯普胺(胃复安)、多潘立酮(吗叮啉)等。增强胃的蠕动，促进胃排空以及幽门和十二指肠的扩张，加速食物通过。
2.结合胆盐类药物：如达喜(铝碳酸镁)，通过与胆酸和溶血磷脂酰胆碱结合，继而减轻胆盐对胃黏膜的损伤，对胆汁反流性胃炎效果明显，为临床上主要用药。
3.抑制胃酸药：胃酸和胆汁有叠加的作用，对胃黏膜的损伤作用强，抑酸药对胆汁反流者同样有效。常用的抑酸剂主要为H2受体阻断剂（H2RA）及质子泵抑制剂（PPI）。
4.抗幽门螺杆菌治疗：幽门螺杆菌感染引可以起胃黏膜炎症，胆汁反流性胃炎可与幽门螺杆菌感染并存。因此，对胆汁反流性胃炎合并HP感染者的治疗，在常规应用抑酸剂、胃黏膜保护剂和胃动力药物的同时。还应首先考虑根除幽门螺杆菌。这不但有利于疾病的愈合，更可减少诱发癌变的可能。
