馒头的发酵方法很多，有老面发酵法、酒曲发酵法、化学膨松剂发酵法、酵母发酵法等等。在生活当中最常见的的就是酵母发酵。
用酵母作为发酵剂是最好的，营养学上把它成为“取之不竭的营养源”，酵母的营养价值是非常全面的，用酵母作为发酵剂蒸出来的馒头不仅味道好，而且还提高了馒头的营养价值。
其实，小苏打发酵，老面发酵，酵母发酵这三种最常用的发酵方法在原理上是一样的，都是通过发酵剂在面团中通过产生大量的二氧化碳气体，在蒸的过程中，温度逐渐升高，二氧化碳受热膨胀，面团中就会产生多孔结构，变得松软好吃。但是这三种发酵方法在营养价值和口味上是有区别的。
用小苏打发酵，蒸出来的馒头不但很松软而且口味也非常好，但是小苏打会严重破坏面粉中的B族维生素。而在日常饮食中，人体所需的维生素B族主要就是通过粮食获得，这使蒸馒头用小苏打发酵得到很多营养学家的强烈反对。小苏打就是常说的碱面，在很多小吃摊和粥铺常会用到这种物质，它可以让熬粥的时间缩短，可以让含很少米粒的粥里看起来粘稠，但是它同时也将稻米中的维生素B族破坏的所剩无几。
用老面发酵并不会破坏面粉中的营养物质。发酵后，面粉里含有的植酸可被分解，植酸阻碍钙、铁、镁等元素的吸收，这使得机体更容易吸收和利用这些营养物质。但是这种发酵方法会使面团产生酸味，导致很多人对馒头的口味很不满意。
酵母发酵可以说是营养学家最推崇的一种面粉发酵方法，蒸出的馒头不仅味道好而且营养价值也非常高。
酵母有干酵母和鲜酵母两种，属于单细胞微生物。酵母本身是可食用的，而且营养丰富。酵母不仅含有三大产能营养素碳水化合物、蛋白质、脂肪，而且还富含矿物质、维生素和酶类，尤其是维生素B族。每1kg干酵母蛋白质的含量，相当于2kg大豆、2。5kg猪肉或5kg大米中蛋白质的含量。
因此可以说，用酵母发酵蒸出的馒头所含的营养成分比起老面发酵，要高出3倍多，蛋白质也要增加近2倍。此外，酵母里还含有硒、铬等矿物质，有抗氧化延缓衰老，预防肿瘤和心血管疾病的作用，还能提高人体免疫力。
