违约金是看你当时签订的合同上有无约定的，跟培训关系不大，除非是约定了培训过离职时要缴违约金的情形。你没外出培训过，那就主要看合同约定了。
住房公积金的提取各地政策不同，在你当地住房公积金管理局网上查查看需要什么手续提前。比如深圳这边凭租房合同或者购房合同就可以提，不知你那边是什么条件？
需要提前，期间肯定要上班。具体多长时间，先跟你领导和院里沟通下吧，制度是死的，人是活的，可以灵活处理的。
档案户口，你辞职了（正常程序）单位就要让你迁走的，不会扣着。流程是你如果找好了下家单位，就转过去，如果没有就先找个人才交流中心挂靠吧。
祝好。
