方法如下：
一、取WinPE 准备好添加程序
1、 一般情况下，常用的WinPE ISO映像文件中，在“MINIPE”目录下会有一个“*.IS_”格式的文件(WinPE的外置软件，一般经过压缩，这里是WINPE.IS_，不过并不是所有WinPE都有“*.IS_”格式的文件，如果在目录中找不到该种格式的文件，就不能采用下面的方法添加软件)，用UltraISO打开后，用鼠标右键点击该文件，再在快捷菜单中选择“提取到”，将该文件提取出来(以提取到目录“E:\TEST”为例)。
2、添加软件到WinPE有两种运行方式，一种是添加到桌面，一种是添加到开始菜单，可以根据自己的习惯灵活选择，这里以将Foxit Reader添加到桌面为例来说明操作过程。
3、注意：因为WinPE的特殊性，要添加的必须是绿色软件，否则无法运行。这里有一个小技巧，可以在添加之前先用WinPE启动系统，再测试硬盘中这些待添加的软件能否正常运行，如果提示缺少DLL文件，就把操作系统目录下面的相关文件复制到该软件所在目录中，直到不提示出错为止。
二、添加软件软件帮忙更简单
1、要添加软件到WinPE当中，用手动添加的方法很麻烦，需要用到DOS命令行软件和DOS命令参数，对于普通用户难度较大，也很容易出错。就不那么麻烦了，利用一款小软件——Windows PE内置软件添加工具即可，推荐使用2.0版本，它支持批量添加软件，操作更方便。
2、启动Windows PE内置软件添加工具后，点击“选择IS_文件”按钮，选择文件“WINPE.IS_”所在目录，这里就是“E:\TEST”，再点击“解析”将WinPE的软件列表显示出来。
3、点击“选择添加目录”按钮，选择软件“Foxit Reader.exe”所在目录，该目录中的所有文件都会显示在左下角的文本框中(如果是单文件的绿色软件，将只会显示出一个文件)，双击执行文件“Foxit Reader.exe”，该文件就会泛灰显示，默认添加位置就是添加到桌面，所以位置不用修改，直接修改桌面显示名称为“Foxit Reader”即可。
4、点击“确认添加”将文件复制到指定目录，再点击下方的“封装成IS_”，就会自动生成ISO映像文件并压缩成“WINPE.IS_”，出现提示窗口表示制作完成，随后用UltraISO打开WinPE映像文件，把新的文件“WINPE.IS_”覆盖原有文件“WINPE.IS_”，并保存，新的ISO文件就创建成功!
5、提示：将软件添加到开始菜单的方法和上面类似，只是添加方式改为“添加到开始菜单”即可。
三、程序验证创建工具盘
在创建U盘工具盘之前，需要先测试一下创建的ISO映像文件是否有问题，建议在虚拟机中加载修改过的ISO文件，启动后就可以看到桌面上已经多出了软件“Foxit Reader”图标。经过测试后软件都可以正常运行说明软件添加成功，再用UltraISO写入U盘即可。
