1994年7月2日，埃斯科巴在麦德林郊外的一家酒吧外被枪杀。根据ESPN记录片《两个埃斯科巴》，当夜埃斯科巴不顾女友和朋友的劝告，坚持去当地一家酒吧，因为他觉得他的生活应该继续。
在喝了几杯酒后，他开始谈论足球并与人产生了争执，对方嘲笑他的进球”非常漂亮“。争执一直持续到酒吧外，凌晨3点左右，数名枪手将其包围并乱枪打死。
枪杀埃斯科巴的凶手在案发3日后就在哥伦比亚的另一个城市麦德林市被警方逮捕归案。
据后来哥伦比亚当地的电台报道,杀死埃斯科巴的凶手名叫温贝托·穆尼奥斯·卡斯特罗。穆尼奥斯对枪杀埃斯科巴竟然供认不讳。穆尼奥斯在1995年6月被判决有罪，并被处以43年有期徒刑。
2005年10月9日，枪杀埃斯科巴的凶手温贝托-穆尼奥斯-卡斯特罗出狱，他在1995年6月被判处43年徒刑，但因在狱中“表现良好”被提前释放。[2]
