1、权利义务不同
法人企业可以以自己的名义独立享有法律权利，承担法律义务。也就是说，法律权利直接属于企业，而不是所有者或投资者。同样，法律义务由企业直接承担，而不是由所有者或投资者承担。
自然人企业为投资人个人所有，所得归投资人个人所有，企业的风险也由投资人个人承担；投资人投资于个人独资企业的财产和其它个人财产为不可分割。
2、类型不同
自然人企业是一种组织形式；
法人企业是有限责任公司、股份有限公司。
扩展资料：
自然人企业的特征：
1、自然人企业是自然人投资的企业。这一特征要求个人独资企业的投资人必须是自然人。投资形式为独资，即一人投资。
2、自然人企业的财产属于个人投资者所有。这个特性是由前一个特性决定的。个人独资形成的财产，只能由个人投资者所有，不得由别人所有。这就建立了自然人企业的基本产权关系，决定了其经营成果属于个人投资者。
3、自然人企业投资人以其个人财产对企业债务承担无限责任。这是因为自然人企业属于投资者个人所有，收入归投资者个人所有，企业的风险也由投资者个人承担；投资者投资于个人独资企业的财产等。个人财产是不可分割的，是企业清偿债务的基础，这种责任形式由个人成为个自然人企业。
4、自然人企业是一人投资的经营实体。也就是说，它必须是一个真正的实体，从事生产经营，能够享有权利和承担责任，而不是一个虚构的市场实体。
参考资料来源：百度百科-自然人独资
参考资料来源：百度百科-法人企业
