1、企业会计核算基础不同。企业会计以权责发生制为基础，行政事业单位会计以收付实现制为基础。
企业要核算利润，要把应当归属于当期的收入和成本费用按照应当归属的期别进行归集，就是说钱花在当期，成本费用不一定记在当期，钱收在当期，收入不一定记在当期；
而行政事业单位鲜于核算利润，反而注重资金的收入和支出，要按照当期的资金的实际收入和支出进行收入支出的核算，钱花在当期，就把支出记在当期，就是当期的责任。
反映到具体的记账方法上，举个简单的例子，如：企业若买了固定资产，只入资产，不做支出，留着慢慢分摊；行政事业单位买了固定资产，“哗啦”直接全额记支出了。
不过，现行准则规定行政事业单位一般采用收付实现制，也就是说不一定全部使用收付实现制，若全部使用收付实现掉，那还要往来科目干什么？
说到收付实现制，再多说一句，根据刚刚出台的《政府会计准则》，以后行政事业单位的财务会计也要实行权责发生制了，这是为了适应权责发生制政府综合财务报告制度的改革需要！
也就是说我们行政事业单位以后购入固定资产，也不会“哗啦”一下全部记支出了！
2、企业会计有涉税内容，一般的行政事业单位因为没有经营业务，所以不涉及税务，最多代收代缴一下个人所得税。
所以事业单位的会计孩纸是没有税务稽查的烦恼滴！但是也不要高兴太早，因为行政事业单位是需要和财政部门打交道滴，而企业几乎不跟财政部门打交道，除非会计个人去办理会计证书方面的业务。
如果你所在当地的财政资金比较充裕，那么你的工作就按部就班，比较顺畅；如果你所在的当地地方财政僧多粥少，那么就可能会有一些无米之炊、告哀乞怜的烦恼！
其实对于行政事业单位会计来说，最烦恼的不是财政部门，而是各级监督监察部门，这个下边会说到！
3、收入来源不同。企业的主要收入自来客户，行政事业单位的收入主要来自本级财政部门。
所以，如上所说，行政事业单位的会计基本不需要跟税务部门打交道，但是是很需要和财政部门打交道的。
财政资金流动的环节包括：编制预算、申请资金、资金拨付到位、资金支出、预算调剂、决算、接受监督，几乎每个环节都需要和财政部门沟通、对接！
4、企业会计着重核算利润，行政事业单位很少核算利润。
企业的利润是自己赚来的的，所以我们经常称为财务成果；行政事业单位的钱几乎都是财政无偿拨入的，期末花不完的称为结转结余资金。这些结转结余资金很大一部分是不能自由使用的，所以只能称之为财务结果。
也有一部分事业单位有经营业务，所以事业单位会计制度也有“经营收入”、“经营支出”等专门的科目来核算。
5、可能面临的监督检查部门不同。
对企业来说，偷税漏税了会有税务部门来查；部分企业年终的财务报表需要被会计师事务所审计；想向银行贷款，还能还要被银行审查等；据说上市公司还要防记者，不知道真假咧！
而行政事业单位每年会被审计部门例行审计；被财政部门检查资金使用情况、会计信息质量等；要随时迎接纪检监察部门的巡查等等，还有很多专项检查，如领导离任审计，以及各级各类部门对项目资金的专项审计。
感觉行政事业单位面临的监督检查比企业要多，所以现在的财务人员包括领导都是越来越谨慎，毕竟，拿工资而已，不能因小失大，无谓葬送青春和年华！
6、关于项目资金的不同。
在会计核算里，行政事业单位和企业单位相比有一个特别之处，就是很多行政事业单位会有一些项目资金，少则几种，多则上百种，也就是所谓“专款”。
这和企业的政府补助不同，政府补助要么记收入、要么冲减成本费用，当然也有一部分是需要专门核算的。
而行政事业单位的“专款”，顾名思义，就是要“专用”的，当然也要专门核算的。
目前实行业务发生时“收支两条线”记账，期末再对每个项目分别进行结转，一不小心就会混淆，这是很多行政事业单位会计容易出现的问题的地方。
所以，不要小看行政事业单位会计！
7、对于行政事业会计和企业企业的不同，安琦个人认为还有一点，那就是行政事业单位的会计内容比较真实。
行政事业单位基本上都只有一套账，虽然偶有不合规的支出会“变通”入账，但大抵收入和支出的数目和内容是比较真实的，特别是现在“八项规定”以及“巡查”制度以来，从领导到财务人员都是谨慎再谨慎，讲真，连公务接待费用都比以前少多了。
而企业会计呢，很多都有两套账，美其名曰“内账”、“外账”，很多人还堂而皇之教你做“外账”。试想，一个合规的企业怎么会有两套账呢，其目的是什么呢？
