果树苗期的害虫分地下害虫和地上害虫。病害以猝倒病、立枯病为害最大。
地下害虫有蝼蛄、小地老虎、蛴螬、金针虫、衣地甲等，其防治方法有两种：一是农业防治，如精耕细作、轮作倒茬、深耕、中耕除草、选用腐熟有机肥等，均可压低害虫密度。二是化学防治，播种期防治可用药剂拌种，拌种的药剂有50%的辛硫磷乳油、40%的乐果乳油等。0.5千克药剂加入50～100倍水稀释，拌100～250千克种子。5月上、中旬用大水浇灌等措施消灭幼虫。苗期可用50%辛硫磷乳油或90%敌百虫原液加水稀释1000倍浇灌苗根。采用毒谷可防治蝼蛄，兼治蛴螬、地老虎、金针虫。
地上害虫主要有象鼻虫、东方金龟子、蚜虫、潜叶蛾、大绿叶蝉及各种食叶害虫。防治象鼻虫、金龟子类，以毒饵诱杀、留毒、撒拌药的青菜等为主。蚜虫，可用40%氧化乐果乳油1000～1500倍液、20%灭杀菊酯3000倍液、50%菊酯乳油2000倍液、50%抗蚜威水分散粒剂2000～3000倍液、20%康福多浓可溶剂6000～8000倍液、10%吡虫啉4000～6000倍液、40%速蚧克乳油1500倍液等防治。螨类（红蜘蛛），可用螨死净、扫螨净、克螨特、尼索朗等防治。潜叶蛾，可用50%杀螟松乳油1000倍液、25%灭幼脲3号悬浮剂2000倍液、20%杀铃脲悬浮剂8000～10000倍液、20%康福多浓可溶剂2000～3000倍液等防治。蝉类，可用2.5%功夫菊酯乳油2000～3000倍液、50%杀螟松乳油1000倍液、20%灭杀菊酯乳油2000～4000倍液、90%晶体敌百虫1500倍液、20%敌虫菊酯乳油3000倍液等防治。
猝倒病、立枯病的防治方法有三种：一是选择适当的苗圃地，要求苗圃地地势较高，土质应为排灌方便的沙壤土。播种前深翻晾晒，前茬作物无立枯病发生。二是选择适当的播种期，最好选择秋天播种，躲过发病高峰期。若能采用无菌营养盆育苗，效果更好。三是土壤药剂处理，播种前20天，整地后用95%的棉隆粉剂，每平方米用量30～50克，混合细土，均匀撒于地表，浅翻拌后洒水压实，播种时松土。也可在播种时用40%硝基苯粉剂加500倍细土覆盖种子。苗期喷70%敌克松可溶性粉剂500倍液，或50%多菌灵可湿性粉剂（500倍）喷雾。每隔3～10天喷1次，连喷3次。除以上两种病害外，还有褐斑病、白粉病、赤星病、花叶病等。防治药剂有波尔多液、碱式硫酸铜、石硫合剂、甲基托布津、复方多菌灵、代森锰锌、粉锈宁、菌毒清等。特别对早期发现的花叶病，喷300倍的菌毒清加800倍C-双效微肥，连喷3遍有明显防治效果。
对已确定是病毒苗的，要立即拔除烧掉。
