我来回答你：总的来说你的担心都是多余的，新公司法修定时对二人公司各50%出资的法律关系已经有制衡条款了，说白了，二人公司且股权等，要操作这样的公司必须是这两个股东非常和谐，否则无法正常经营，为什么呢？简单回答你的四个问题就可知道了；
1、你说“三证”上都是法定代表人的名字，另一个股东的名字怎样体现呢？其实这里的法定代表人名字所代表的是“公司”，（这是公司法规定的），用这个名字来代表公司，公司如果违法，用这个名字承受人来承担，去为公司罚款（行政处罚时），代表公司去坐牢（刑事处罚时），但公司的经济损失最终由你们两个股东来承担，另一个股东就被体现了，所以某种意义上来讲，法定代表人的名字其实是一种责任，比另一股东责任风险更大；
2、法定代表人的权利问题，说白了是一种像证意义的权力，因为公司权利部门是股东会，公司法规定股东会决定公司决策，而两个股东权利是相等的，各为50%表决权；
3、另一个股东本身就有召集股东会的权利，所以无需再任命什么行政职务了，股权是最大的权力了；
4、综上所述，最好的办法是两个股东协商经营，互相配合，不然都可互相制压的，无法独权的
