1.企业缺乏完善的财务制度。有很多中小企业都没有一套完善的财务制度，，账证不全，核算不规范，做假账、糊涂账，对内一套帐，对外一套帐，有少数企业还是“三无”企业。这些现象的出现主要是因为中小企业内部的财务制度不健全，包括内部牵制制度、稽核制度、定额管理制度、计量验收制度、财务清查制度、成本核算制度、财务收支审批制度等总的来说残缺不全。
2.会计基础工作薄弱。由于很多中小企业都是“家族式”管理，会计人员都为企业管理层的亲属，而对于外聘的高级会计人员处处提防，直接造成企业会计人员的专业素质低下，层次不清、分工不明。会计从业人员资格认定及考核不规范，会计无证上岗工作现象严重等等，这种不具备会计专业技术资格的现象不胜枚举。另外，建账不规范或不依法建账也是会计基础工作薄弱现象的一个表现。会计核算常有违规操作，有些中小企业根本不设账，以票代帐，或者设账，但账目混乱。还有相当一部分中小企业设两套账或多套账。在会计核算方面，待摊费用预提费用不按规定摊提，人为操纵利润，采用倒轧账的方式记账等等。
3.内部会计监控不力，外部监控随意。国家的监督重点放在大型企业，对中小型企业的外部监督就显得比较软性化，没有法规、条例支持。所以，对中小企业的外部监督主管多于客观，随意多于规范。监管力量主要来自于注册会计师和地方政府及工商、税务、银行等部门，但监管力度不大，大部分监督部门只是站在各自的立场各行其是。
4.用以证明经济业务发生的原始凭证付出成本大，或者难以获得。原始凭证的获取要付出成本，是因为企业在购买商品物资时要不要发票存在着不同的价格，若要发票，要加价，价格较高；不要发票价格较低，两者的差价就是税款。中小企业往往希望以较低的价格成交，但是又无法取得记账所需的合法凭证。还有的企业发生费用后无法取得发票，只能取得不合规的收据。
三、规范中小企业会计核算的措施
1.完善中小企业会计制度，保证会计制度的适应性和可操作性。建立一套完善的财务制度，在会计实际工作中严格按照公司财务制度执行。
2.加强财会人员队伍建设
