答：我们先分别对这两个定义进行了解。
行政机关公文指是行政机关的公文（包括电报），是行政机关在行政管理过程中形成具有法定效力和规范体式的文书，是依法行政和进行公务活动的重要工具。《国家行政机关公文处理》
党的机关公文，是党的机关实施领导、处理公务的具有特定效力和规范格式的文书，是传达贯彻党的路线、方针、政策，指导、布置和商洽工作，请求和答复问题，报告和交流情况的工具。《中国共产党公文处理条例》
它们之间的区别是党针对内行文，行政针对外行文；最大的区别是党的机关以领导教育为主，行政机关以对外执行行为为主。
