先交后退的不能扣除，已经交了、不再退还的可以扣除。《土地增值税暂行条例实施细则》第七条
条例第六条所列的计算增值额的扣除项目，具体为：
(二)开发土地和新建房及配套设施(以下简称房地产开发)的成本，是指纳税人房地产开发项目实际发生的成本(以下简称房地产开发)包括土地征用及拆迁补偿费、前期工程费、建筑安装工程费、基础设施费、公共配套设施费、开发间接费用。
扩展资料：
土地增值税的开征，具有极其重要的作用：
（1）有利于增强国家对房地产开发商和房地产交易市场的调控；
（2）有利于国家抑制炒买炒卖土地获取暴利的行为；
（3）有利于增加国家财政收入为经济建设积累资金。
土地增值税只对“转让”国有土地使用权的行为征税，对“出让”国有土地使用权的行为不征税。土地增值税既对转让国有土地使用权的行为征税，也对转让地上建筑物及其它附着物产权的行为征税。
土地增值税只对“有偿转让”的房地产征税，对以“继承、赠与”等方式无偿转让的房地产，不予征税。不予征收土地增值税的行为主要包括两种：
①房产所有人、土地使用人将房产、土地使用权赠与“直系亲属或者承担直接赡养义务人”。
②房产所有人、土地使用人通过中国境内非营利的社会团体、国家机关将房屋产权、土地使用权赠与教育、民政和其他社会福利、公益事业。
参考资料来源：百度百科-企业所得税
