可以从以下几个方面的挑选上等的金刚菩提：
1、首先需要将所有的金刚菩提子过手一遍，将阴皮，糠籽全部剔出去，因为这样的籽有些盘不红，而且密度非常差，不适于盘玩。如图示中非常明显可见的一大块黑色阴皮，会严重影响金刚菩提子的整体品相，因此这样的籽要在挑选的过程开始就将其剔除。
2、接下来按照瓣数区分，正常情况下尼泊尔大金刚菩提子多数均为五瓣，少量六瓣，另有极少数四瓣七瓣八瓣九瓣甚至多瓣等极品，要仔细观察后区分开来。
3、挑选通货第一步是将其按尺寸区分开，我们只需要一把卡尺就足够了。
4、因为金刚菩提籽生长的不规则性，是以菩提最大尺寸为准，正常情况大金刚菩提的尺寸是在18－23之间，有极个别的小籽或极个别大籽，均是以此法优先分类，将尺寸相同的籽全部放在一起。
5、接下来根据品相的不同再次进行分类，因为金刚菩提本身下树的时间不同，优先成熟落地的籽在去皮后会呈红色，被文玩内朋友称为红皮，未成熟下地的籽为黄皮，下树时间不同，籽的颜色也有不同，而文玩迷们入手金刚菩提最忌也是色差，因此在挑选的时候应尽量做到无色差，即让其颜色尽量统一。
6、尺寸和颜色统一后再接下来要做的是尽量让金刚菩提桩形统一，金刚菩提本身生长过程中因受到的营养成分与日照等因素不同其尺寸桩形纹路都会有很大区别。
7、经由上面个步骤之后分类出的金刚菩提子就会有明显的区分了，红皮黄皮颜色区分，尺寸大小区分，桩形纹路区分，之后可以挑选任何一种搭配，如红皮五瓣21飞碟蜂巢纹路，即可在任何区间中挑选，会方便很多。
