1、补救方案：
（1）、从发票来处理，开具对应发票的红字发票
（2）、从合同来处理：调整合同主体与发票流一致
2、据理力争方案：根据增值税暂行条例实施细则第12条（三）同时符合以下条件的代垫运费：1.承运部门的运费发票开具给购货方的，2.纳税人将该项发票转交给购货方的。所以运输发票可以由承运方开具给委托方。
扩展资料：
一、纳税人通过虚增增值税进项税额偷逃税款，但对外开具增值税专用发票同时符合以下情形的，不属于对外虚开增值税专用发票：
1、纳税人向受票方纳税人销售了货物，或者提供了增值税应税劳务、应税服务；
2、纳税人向受票方纳税人收取了所销售货物、所提供应税劳务或者应税服务的款项，或者取得了索取销售款项的凭据；
3、纳税人按规定向受票方纳税人开具的增值税专用发票相关内容，与所销售货物、所提供应税劳务或者应税服务相符，且该增值税专用发票是纳税人合法取得、并以自己名义开具的。
4、受票方纳税人取得的符合上述情形的增值税专用发票，可以作为增值税扣税凭证抵扣进项税额。
参考资料来源：
