第一，两者的目的不同：
体力劳动是为了创造社会财富，体育运动是为了锻炼身体。体力劳动是由于工作性质的需要，不能进行剧烈的跑跳，对身体的锻炼作用不如体育运动大。实践证明，在一定限定内，运动的强度越大，对身体的锻炼作用越大。
从事体力劳动时，心跳虽然也加快，但是加快的不多，每分钟常在70-90次左右，而剧烈运动时，心跳可增加到每分钟100-150次，这就把贮存在血库里的血液送往全身各处，使全身得到较多的营养，抵抗力增强，新陈代谢旺盛，内脏器官的功能提高。
第二、内容不同：
体力劳动时，由于工种不同，身体常处于固定姿势，肌肉的活动也是单一动作，不能使整个身体得到全面锻炼。像车工、售货员、理发师总是站着干活，翻砂的工人及拔草的农民总蹲着干活;煤矿工人、插秧的农民多的弯着腰干活;这样，全身各自的肌肉用力很不均衡，费力的肌肉过于紧张，容易造成疲劳;省力的肌肉得不到活动，受不到锻炼。再加上体位变化很少，往往引起肌肉慢性劳损和职业病。如经常弯腰工作的人，容易引起下肢静脉曲张。
如果在工间或工作之余，做做工间操、生产操、打打太极拳、散散步等方式进行适当做运动；就能使身体的位置发生改变，工作中紧张的肌肉得到放松，省力的肌肉得到锻炼，不仅有利于身体全面发展，而且能防止肌肉劳损和职业病的发生。
由于社会分工不同，有很多人在室内从事体力劳动，他们吸收新鲜空气及照射阳光较少，身体缺乏紫外线，影响正常的新陈代谢和生命力，如在工间到室外运动一下，不仅锻炼了身体，而且能多吸收新鲜空气和照射阳光，对身体有好处。
体力劳动之后，适当参加体育运动有利于消除疲劳。有人做过这样的试验，一种方法是先用右手摇某一种东西，等右手疲劳后，再用左手摇，这样右手的疲劳消失较快;另一种方法是先让右手摇某一种东西，等右手疲劳后，两只手都休息，试验的结果，右手的疲劳消失较慢。医学上把这种奇怪的现象，称为大脑皮质的诱导作用。
参考资料来源：中国网-体力劳动不能代替体育运动
