由显性基因突变成隐性基因叫隐性突变，由隐性基因突变成显性基因叫显性突变。绝大多数为隐性突变。
（1）对于性细胞：
如果是显性突变,即aa→Aa，可通过受精过程传递给后代，并立即表现出来。
如果是隐性突变，即AA→Aa，当代不表现，只有等到第二代突变基因处于纯合状态才能表现出来。
（2）对于体细胞：
如果显性突变，当代表现，同原来性状并存，形成镶合体。突变越早，范围越大，反之越小。果树上许多“芽变”就是体细胞突变引起的，一旦发现可及时扦插、嫁接或组培加以繁殖保留。
如果是隐性突变，当代不表现。
基因突变导致原来的基因变成了它的等位基因，而且是不定向的：即一个基因可朝着不同的方向发生突变；可以是显性突变，也可以是隐性突变，但较多的是隐性突变。
