1、一般诉讼时效是2年，过期是不受法律保护的。也就是说，你的案例已经过了2年时间，他可以起诉你，法院也会受理，但法律上不保护他的权益。
2、通过这件事情，你也要接受教训，以后办理资金收付，一定要开具收据，将剩余的资金付给任何人，包括老板，都要留个一式多份的字据，以免有些人不认账。
3、原来的账做的特别乱，如果只是处理上很乱，你没有贪污或挪用他的资金，这个他要起诉你，你也不用担心。就象工人生产产品一样，员工非故意把他加工成次品，老板总不能让员工赔偿吧——也就是说，他既然录用了你，你没有出现任何法律范围内的责任，只是工作能力不到位而造成失误（只是账务处理较乱，不牵扯任何资金问题），这是老板的责任，他要承担领导责任，你不必担心。
4、不要逃避这件事情，勇敢面对，如果故意逃避，即使没事也成有事了。
5、因为你已经离职三年，就是你在离职时，我想应该已经办理清楚了交接单，现在他说你还有资金没给他，应该说不过去。如果钱没给他，他能让你办理离职手续吗？
6、强调一点，如果你真没贪污，就理直气壮，不要担心起诉。起诉只是一个维权的法律程序，这样也能洗刷你的清白。届时你也可以反起诉他，破坏你的名誉。
