不应该扣除。
养老保险单位缴基数的20%，个人缴基数的8%，医保单位交基数的10%，个人缴基数的2%加大病统筹3元。个人所得税是扣除养老保险和医疗保险后还超过3500才缴税。
《社会保险费征缴暂行条例》第四条 缴费单位、缴费个人应当按时足额缴纳社会保险费。征缴的社会保险费纳入社会保险基金，专款专用，任何单位和个人不得挪用。
第十二条 缴费单位和缴费个人应当以货币形式全额缴纳社会保险费。缴费个人应当缴纳的社会保险费，由所在单位从其本人工资中代扣代缴。社会保险费不得减免。
扩展资料：
《个人所得税法实施条例》第二十五条的规定，按照国家规定，单位为个人缴付和个人缴付的基本养老保险费、基本医疗保险费、失业保险费、住房公积金，从纳税义务人的应纳税所得额中扣除。
单位为职工承担个人应负担部分的法定保险金，如果已并入员工的工资薪金所得，在计算工资薪金所得时允许扣除；如果没有并入工资、薪金所得，在计算应纳税所得额时也不再扣除。
参考资料来源：百度百科-个人所得税法实施条例
