员工8月份入职新公司，9月份发放工资后进行个税预扣预缴申报，累计减除费用是按照5000元填写。
工资扣税的计算公式如下：应纳税所得额=月综合工资-5000元基本减除费用-五险一金，应缴个人所得税金额=月应纳税所得额×税率%（超4500元-9000元内，税率为20%）。
实际申报个税时，一般都是通过自然人电子税务局扣缴端进行个税申报扣缴，累计减除费用，累计专项扣除等，系统会自动累计。
扩展资料：
注意事项：
国家税务总局早有规定，国家税务总局公告2018年第61号文第六条规定, 扣缴义务人向居民个人支付工资、薪金所得时，应当按照累计预扣法计算预扣税款，并按月办理扣缴申报。其中累计减除费用，按照5000元/月乘以纳税人当年截至本月在本单位的任职受雇月份数计算。
纳税人如果5月入职，扣缴义务人5月份发放工资扣缴税款时，减除费用按5000元计算，扣缴义务人6月份发放工资扣缴税款时，减除费用按10000元计算。
参考资料来源：人民网-广东调整新入职人员劳务报酬个税预扣预缴规则
参考资料来源：百度百科-个税专项附加扣除
