公益性项目评价，是以不断改善投资环境、优化产业结构、实现宏观经济持续增长为目标，从纳税人的角度出发，采用效益费用等分析方法，考察公益性项目给社会公众带来的效益是否大于项目投入的费用，为公益性项目的选优决策提供依据。1、公益性项目的经济评价
公益性项目的经济评价包括反映微观经济效应的财务评价和宏观经济效应的国民经济评价。财务评价是指在国家现行财税制度和价格体系的条件下，从项目财务角度出发，计算公益性项目的财务盈利能力和清偿能力，据此判断项目的可行性。财务评价可从财务数据基础估算、财务效益评估两方面着手。财务基础数据估算是进行财务评价和开展经济评价的前提和基础，财务基础数据估算的结果是否可靠直接影响财务评价和国民经济评价的结论。财务基础数据估算分析的主要对象是成本和收益，通过两者的比较说明项目效益的好坏，其主要包括项目总投资及资金来源与筹措、总成本费用估算、销售收入估算、税金及附加估算、利润与分配估算等。财务效益评估是项目评估的重要组成部分，他分析计算项目直接发生的财务效益和费用，编制财务报表、计算评价指标、考察项目赢利能力、清偿能力以及外汇平衡等财务状况，据以判断项目的财务可行性以便于项目的投资决策提供科学依据。一般财务基础数据估算为财务效益评估提供客观准确的基础数据，而财务效益评估是在此基础上评估项目是否具有可行性。
国民经济评价是按照资源合理配置的原则，从国家整个角度出发分析，采用影子价格、影子汇率、影子工资、社会折现率等经济评价参数，计算公益性项目对国民经济的净贡献，据以判断项目的经济可行性。公益性项目经济评价以国民经济评价为主，财务评价为辅。
2、公益性项目的社会评价
我国公益性项目社会评价方法以我国建设有中国特色的社会主义理论为理论基础，参照社会费用效益分析原理、社会影响评价与社会分析的理论方法，从实际出发，实事求是，在我国已有经验基础上吸取经验，建立适合中国特色的项目社会评价的理论方法。公益性项目评价应遵循以下几条原则：
（1）要符合并反映社会主义基本经济规律的要求，此评价要正确反映各类公益项目最主要、最基本的功能，既要兼顾项目对国民经济整体的影响，要要体现项目直接服务对象的居民利益；
（2）科学性和适用性相结合，评价方法的制定力求要有科学依据，要理论联系实际，讲求实用，适用中国国情，要具有较强的方案比选功能；
（3）定量分析与定性分析相结合；
（4）通用指标与专用指标相结合：就业效益指标、收入分配效益指标、节约自然资源指标、环境影响指标；
（5）统一性与灵活性相结合，公益性项目的社会效益十分广泛，涉及面广阔，因此制定的通用的评价方法要注意广泛的适用性，并对各行业具有一定的灵活性。1．评价指标性质不同
政府及非营利组织兴建项目是为了保护国家及人民生命财产安全，为公众和企业提供满意便捷的服务，公众享受服务有时免费，有时仅按准成本或成本付费，政府及非营利组织兴建和维持公益性事业的的经济来源主要是财政收入，即纳税人的上缴税金。在这种情况下，不可能采用盈利最大化指标来评价拟建项目的可行性和合理性。
2．评价指标计算方式不同
计算财务评价指标时，现金流入和流出针对的是一个投资主体。而在计算公益性项目评价指标B/C时，效益主要是社会公众享受到的好处，费用主要是投资主体对项目的投入。
3．评价指标数量不同
对竞争性项目进行财务评价时，采用可货币化的、单一的盈利能力指标就足够了。但公益性项目几乎都有多方面的无形效果，诸如收入分配、地区均衡发展、就业、教育、健康、生态平衡、社会安定、国家安全等。由于不存在相应的市场和价格，无形效果一般很难赋予货币价值，必须寻找其他方法对项目的无形效果进行评价。
4．评价指标之间协调的难易程度不同
对竞争性项目进行财务评价时，各盈利能力指标之间的关系是协调的，尽管各利益主体之间也会出现不一致，但协调起来比较容易，往往不影响大局。但不同的公民对公益性项目的多个指标关注的侧重点往往不同，这可能导致指标相互之间具有显著的冲突，而且协调矛盾的难度也较大，从而增加项目选优的复杂性。
