当然是两次。一国侵犯另一国主权才叫侵略、侵占。
第一次是荷兰人侵占台湾,明末清初时郑成功收回,将台湾作为抗清的根据地。后来康熙帝派施琅打败郑克塽,台湾归属中国中央政府管辖。
第二次是日本根据《马关条约》割占台湾,1945年二战日本战败,被迫将台湾归还中华民国政府。台湾再次归属中国中央政府管辖。
1949年中华民国国民政府败退台湾,不叫侵占,是中国国家分裂,两个政党分别在中国成立了两个政府。1971年26届联合国大会前,中华民国政府是国际社会承认的中国的合法政府;26届联大后,国际社会承认中华人民共和国才是中国的合法政府。