在680年卡尔巴拉之战中，阿里次子侯赛因被杀，引起了一系列在什叶派思想影响下的暴动，规模最大者为685~687年在库法爆发的穆赫塔尔起义。起义参加者除阿拉伯人外，还有非阿拉伯人的新穆斯林——麦瓦立人，什叶派随之传播到非阿拉伯民族中。
起义失败后，其余部形成什叶派凯萨尼支派。该支派主张，阿里的权力是从穆罕默德继承下来的，不承认前三任哈里发的合法性，并创立了隐遁伊玛目和马赫迪（救世主）复临人间，恢复正义的学说。认为阿里的第三子伊本·哈乃菲叶是隐遁伊玛目。这些主张对后来什叶派宗教学说的发展提供了重要内容。此后，围绕着侯赛因之子栽因·阿比丁形成了什叶派伊玛目派，因其第六代伊玛目贾法尔·萨迪格奠定了该支派的教法学基础，故亦有人称其为贾法里学派。
