影响中国经济增长方式实现根本转变的一个关键性问题是，市场机制在资源配置中的基础性作用没得到很好的发挥。
在出席全国政协十届四次会议中外记者招待会时，吴敬琏表示，这种体制性障碍主要有四条：一是各级政府仍然保持着过大的资源配置权力；第二，GDP的增长率成为政绩的首要考虑；第三，出于财政收入的考虑，要求产值实现最大增长；四是要素价格与资源价格扭曲。
改革开放以来，关于转变经济增长方式的问题始终摆在中国经济工作的议题上，尤其在“九五”计划中明确规定，要实现两个根本转变——一个是实现经济增长方式从粗放型到集约型的转变，另一个是经济体制从计划经济到市场经济的转变。
“为什么要求转变但转变不过来？”吴敬琏表示，其中一个很重要的原因就是体制上的障碍，“包括像我这样的经济学家在当时认识不是那么清晰、不是那么具体，这次我们大有进步。”
吴敬琏表示，体制上的障碍表现为政府、官员仍然掌握着很重要的资源配置权力，而价格作为市场配置资源最重要的工具、最重要的手段，又因为行政因素扭曲了，使得企业在选择生产决策时也发生了扭曲。
“他们受到两个压力：政绩和财政收入的压力。现在的财政税收主要来自生产型的增值税，而生产型增值税和产值之间是直接联系的。”吴敬琏表示，在两个压力下，他们不惜用自己手里掌握的资源去支持高速度，所以增长方式就难以转变过来。
