至2010年,九寨沟已发现陆生野生动物619种,有大熊猫、金丝猴、雉鹑、绿尾虹雉、羚牛、林麝、雪豹等珍稀动物20余种。野生珍稀动物资源共有17种。其中一类保护动物有大熊猫、牛羚、金丝猴、大天鹅等;二类保护动物有毛冠鹿、白唇鹿、小熊猫、猕猴、林爵、红腹角雉、绿尾虹雉等;三类保护动物有鬃羚、斑羚、蓝马鸡、血雉等。
至2010年,九寨沟林业用地达35.7万公顷,森林植被覆盖率69.75%,是四川省第二大林区,有天然草场186万亩。天然中药材290种,主要有党参、当归、虫草、贝母、天麻、猪苓等,盛产国家地理标志产品“九寨刀党”。药用植物467种,蕴藏量500多万公斤;野生虫草、贝母等药材和大熊猫、金丝猴、牛羚等。山野菜和金榜柿、陵江核桃、黑木耳等优质农产品畅销海内外。野生植物2033种,有银杏、红豆杉、独叶草等珍稀植物33种。