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九寨沟海拔高差大，地形地貌复杂，植被类型丰富，保留有大面积的原始生态环境，为不同类型的动物提供了适宜的栖息环境。湖面，野鸭水鸟起落；林中飞禽走兽云集。据有关部门粗略统计，生活在这里的野生动物，已知的就有近300种。其中被列为国家重点保护的珍稀动物27种，如大熊猫、金丝猴、牛羚、白唇鹿、黑颈鹤、天鹅、鸳鸯、红腹角雉、雪豹、林麝、水獭等，九寨沟堪称动物王国。
大熊猫
大熊猫迄今已有几百万年的生活史了，它是地球幸存的最古老的动物之一，故有“动物活化石”之称。目前世界上仅存于我国少数地区，堪称稀世珍宝。
九寨沟的大熊猫主食箭竹，性情比较温顺，它那副胖乎乎、慢悠悠的憨态很讨人喜欢。大熊猫是昼夜都活动的动物，每天活动时间在16-18个小时，6-8小时为休息时间，白天活动略高于夜间。九寨沟的大熊猫一般都在则查洼沟、日则沟一带活动，冬天也会下到海拔较低的树正沟、扎如沟等地避寒。幸运的游客有时也能在箭竹海、熊猫海等箭竹茂密的景点发现它们的行踪。
别看大熊猫走起路来慢吞吞的，它的听觉可是十分灵敏，一旦发现敌情，即刻就能逃走隐匿，而且它还自有一套克敌制胜的妙法: 豺狗是一种凶残狡诈的野兽，它们常常成群袭击比自己大得多的猛兽，连凶猛的马熊也不能逃脱，但当熊猫遇上成群豺狗的进攻时，它总是先爬上树去，稳稳地坐在大树枝上，居高临下，等待时机反攻。豺狗不会爬树，只能贪婪地围着大树乱转，待它精疲力尽之时，大熊猫便从树上一跃而下，坐在地上，摆开迎战的“姿势”。当豺狗一扑上来，不是被它飞掌打得鲜血直流，就是被它撕得五脏俱裂。
天鹅
天鹅为春季北飞，冬季南迁的候鸟，飞行能力极强。它们爱在湖泊和沼泽地带栖息，主食水生植物，兼食贝类、鱼虾。九寨沟常见的天鹅有大天鹅或小天鹅。
绿尾虹雉
绿尾虹雉栖息于海拔3000—4000米的高山草甸灌丛或裸岩之中，是世界著名的珍贵雉鸡之—，因喜食贝母球茎又叫“贝母鸡”，又由于有时潜入药农、猎人住地食木炭，所以也称“火炭鸡”。
红腹锦鸡
我国特产，雄鸡头顶有发状冠羽，后披到颈。颈部由长而宽的彩羽构成“翎领”，“翎领”羽色从上到下，由金黄过渡至锈红，并杂以翠绿，发情时，“翎领”竖立如扇。红腹锦鸡在九寨沟内随处可见。
川金丝猴
世界上的金丝猴分为三种，其中川金丝猴分布于四川、山西、甘肃、湖北等地方，生活在针阔混交林和针叶林中。川金丝猴属灵长目，生性机敏，以野果为主食，常栖息在云杉、冷杉林带。川金丝 猴体型中等，颜面为蓝色，颈侧棕红，披一身金色长毛，背毛达30厘米以上，鼻孔朝上，故有“仰鼻猴“之称，是动物世界中的珍品。川金丝猴只产于我国，九寨沟的金丝猴是川金丝猴。
神猴
川金丝猴性喜群居，一群金丝猴少则几十只，多则数百只。猴群有“首领”，首领有“警卫”。猎食的时候，首领警卫站在高处指挥，发现险情就吼叫几声，猴群听见信号，转眼间就逃得无影无踪。
九寨沟里有经验的猎人能通过对金丝猴的观察来预知天气。一旦气候将变，敏感的金丝猴就会坐立不安，时而上窜下跳，时而吱吱乱叫，要不了多久，就会有一场大雨降临。由于金丝猴这种“呼风唤雨”的本领，当地人将它们称为“神猴”。
鸳鸯
鸳鸯是我国著名特产。它体态玲珑，羽毛绚丽，一对棕色的眼睛外围黄白双色环，嘴呈棕红色。鸳鸯喜幽好静，常浮游于安谧的湖面，或栖于僻静的树洞。鸳鸯雌雄偶居不离，双宿双飞，古称“匹鸟”。
松潘裸鲤
松潘裸鲤，俗称“林叶子”，无鳞，体形细小，生长缓慢，性成熟迟，杂食性，属特化型高原山区冷水型鱼类。松潘裸鲤的确是鱼类中的幸运儿，它们独居翠海，被九寨沟人视为水中精灵，从不捕捉食用。令人惊奇的是其它鱼类似乎与九寨沟无缘，1983年四川省水产局和都江堰管理局在镜海试放了55尾虹鳟鱼，结果一年后竟不见踪影。
蓝马鸡
蓝马鸡通体蓝灰，头侧绯红，耳羽白色并明显地突出颈顶之上，酷似一副京剧武将脸谱。特别引人注目的是那分散下垂如马尾的尾羽中央，长出一对有金属光泽的特长羽翎。蓝马鸡为我国特有，在世界上与大熊猫、金丝猴一样，备受青睐。
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