一、区别：
1、使用场合不同：正方形财务专用章用于在银行开设对公账户、开支票、取款转账；圆形财务专用章只能在对公司内部的业务中使用，如发文，通知等。
2、雕刻流程不同：要到“中国人民银行”预留公司公章的印鉴和该印鉴，并要到公安机关备案；圆形财务专用章只需要到公安部门申请备案。
二、分别用于：
正方形财务专用章用于在银行开设对公账户、开支票、取款转账；圆形财务专用章只能在对公司内部的业务中使用，如发文，通知等。
扩展资料：
财务专用章，在用途上，规定如下：
为办理单位会计核算和银行结算业务，会计中心为各单位统一刻制了冠有单位名称和“会计中心(序号)”字样的财务专用章，并经单位领导授权后使用。单位原有的财务专用章限用于内部财务管理，但不得用于银行结算。省财政厅为此还专门行文予以规范。
会计中心对财务专用章的使用范围严格限制，并采取与会计主管印章双人分管、保险柜另行存放等项措施，以确保印鉴安全。
单位开户时的账户名称为单位法定名称，预留银行印鉴为单位财务专用章、负责本单位会计核算的核算部会计主管印章和单位确定的财务负责人印章。其中财务专用章由会计中心核算部保存，单位的财务负责人印章由单位报账员负责保存，于每次报账时对支票审核无误后才盖章。
银行账户开设后，经单位审核同意并在开户申请上加盖单位行政公章方可使用。单位银行账户的使用，需中心与单位分别执存的三个印鉴加盖齐全方为有效，否则银行不予受理。
参考资料：百度百科—财务专业章
