朝天椒采摘有很多学问，椒农的采摘经验主要有以下几点：
（1）整秧晾晒：簇生朝天椒整秧收获后，整秧晾晒比单晒椒果脱水快，因为椒果在秧上时水分可以通过输导组织向整个植株散发，而摘下的湿椒好似一个密封的容器，其表面的角质膜阻止了水分散发，不但椒果干得慢，而且椒蒂脱离植株形成的创伤面易遭受真菌和细菌侵染，极易发生霉变，因此最好在整秧晾晒达到标准后再摘椒。
（2）适时摘椒：辣椒收获后整秧晾晒，当辣椒果实含水量降低到18%～20%时，是恰当的摘椒时机。用椒农的说法叫做“手摇籽响”时，即用手摇晃辣椒秧能听到辣椒籽撞击辣椒壁的声音，当晾晒的辣椒有85%以上达到这一程度时，即可摘椒。
（3）喷水巧摘椒：高质量的辣椒干握在手里感觉微有弹性，又不破碎，而在实际操作中总有由于辣椒过于干燥而在采摘过程中破碎的现象。针对这个问题，在摘椒前5～12小时向辣椒棵上喷水雾，水温25～35℃，可洁净椒面，清除灰尘和泥巴，降低辣味对人的刺激，最主要的是摘椒的时候大大减少了椒果破损。椒农管这一技术叫“人工回潮”，喷水主要针对椒果与植株的接触部位。
（4）巧掰椒：在摘干辣椒的时候，由于用劲不当，椒蒂部位的黄色果肉部分容易破损，从而造成椒果不完整，容易感染病菌，因此摘椒时既不要“掐”，也不要“揪”，而要巧用“掰”劲。
（5）阴干脱水：摘下经过“人工回潮”的椒干，要在遮阳的条件下进行第二次脱水干燥，如在通风的阴棚下或通风条件好的室内，而不要在阳光下直晒。多年的生产实践发现经晒干的辣椒，本应鲜红的色泽变得暗淡，红中发白，使外观商品性状变差。原因是辣椒中所含辣椒红素在阳光照射下会发生光解反应。经过一段时间的阴干处理，辣椒含水量达到14%左右标准时，经过挑选分级，辣椒即可出售或存放。实际操作中可把干辣椒对折一下，然后再打开，在对折线上有一条明显的白印，若对折处没有裂痕，此时辣椒的水分含量应为14%左右。特别应指出的是，在整秧晾晒、摘椒和分级挑选过程中也要尽量避开阳光直晒，长期贮藏时最好也避光。
