40年商业公寓二手房正常过户的话，按相关规定则需要缴纳以下费用：
（1）营业税：税率5.55%，由卖方缴纳，同时规定：若是转让出售购买时间不足2年的非普通住宅，需按照全额征收营业税；若是转让出售购买时间超过2年的非普通住宅或者转让出售购买时间不足2年的普通住宅，需按照两次交易差价征收营业税；若是转让出售购买时间超过2年的普通住宅，则免征营业税；如果所售房产是非住宅类如商铺、写字间或厂房等，则不论证是否过2年都需要全额征收营业税；
（2）个人所得税：税率交易总额1%或两次交易差的20%，由卖方缴纳征收有两个条件：家庭唯一住宅以及购买时间超过5年。如果两个条件同时满足可以免交个人所得税；任何一个条件不满足都必须缴纳个人所得税；另外如果所售房产是非住宅类房产则不管什么情况都要缴纳个人所得税。
（3）印花税：税率1%，买卖双方各半，不过至今国家暂免征收。
（4）契税：基准税率3%，优惠税率1.5% 和1%，由买方缴纳，同时规定若买方是首次购买面积不足90平的普通住宅缴纳交易总额的1%；若买方首次购买面积超过90平(包含90平)的普通住宅则缴纳交易总额的1.5%；若买方购买的房产是非普通住宅或者是非住宅则缴纳交易总额的3%。
（5）测绘费:1.36元平米，总额=1.36元平米*实际测绘面积； 一般说来房改房都是需要测绘的，商品房如果原产权证上没有房管局的测绘章也是需要测绘的。
（6）二手房交易手续费总额：住宅6元平米*实际测绘面积，非住宅10元平米
（7）登记费：工本费80元，共有权证:20元。
