以清代学者阮元主持校刻的《十三经注疏》在"十三经"各注释版本中最为完善，是研究中国古代文化的重要参考资料。
历代解释十三经的著作很多,南宋时期始合刻在一起。
南宋绍熙年间始有汇集唐宋之前最具权威性的"十三经"注、疏的合刊本，形成一整套经书及其注文，称为《十三经注疏》，后复有十行本。明嘉靖时期有闽本，据十行本重刻;万历间有监本，据闽本重刻;崇祯时期有毛氏汲古阁本，据监本重刻。但是明代时期的监本和汲古阁本，因辗转翻刻，讹谬百出。
清初有武英殿本。清嘉庆时期，著名学者阮元主持重刻《十三经注疏》，裒集宋本重刊，以十行本为主，并广校唐石经等古本，撰《校勘记》附于诸经卷末，号为善本，是迄今为止最好的本子,素来为世人所看重。
