失代偿性肝病和有发生失代偿可能性的患者，这类患者如果不马上进行抗病毒治疗，5年的生存期只有14%。因此对于失代偿期肝病和有发生失代偿可能性的患者，无论ALT正常与否，只要HBV-DNA阳性，就应该马上开始抗病毒治疗，且应该坚持长期治疗。
HBV-DNA中等水平复制，ALT高于正常上限的2倍以上。如果患者的ALT>正常上限的10倍以上，由于他们可能出现自发的血清学转换，所以可以暂时对症治疗，3个月后再复查病毒载量及肝功能，如果HBV-DNA仍然阳性则可即刻抗病毒治疗。
所以在转氨酶超过正常的两倍时，表明人体免疫系统被激活，开始了与乙肝病毒的排除反应，同时肝细胞表现为炎症性损伤，此时是乙肝抗病毒治疗的最佳时机。人体免疫系统配合抗病毒药物一起对抗乙肝病毒，才能取得较满意的抗病毒效果。
