科学家认为,利用经过遗传工程改造的微生物治理环境污染、保持生态平衡将成为今后保护环境最有效的方法。如硝化细菌可去除碳、氮,杀灭病毒,降解农药,絮凝水体重金属及有机碎屑,它在消解碳系、氮系等有机污染时,也可消解有机污泥。嗜烃菌可短时间去除大部分油污,使其转化为二氧化碳和菌体蛋白。光合细菌能够利用水中残留的有机物作为氢的供体进行光合作用,减少分解水中的有害物质,起到改善水质,相对提高溶解氧的作用。鱼池中只要有5克/平方米的光合细菌,3小时内就能将池底不断产生的氮离子和有机物的初始分解物除去,使水质恢复正常。