科学家认为，利用经过遗传工程改造的微生物治理环境污染、保持生态平衡将成为今后保护环境最有效的方法。如硝化细菌可去除碳、氮，杀灭病毒，降解农药，絮凝水体重金属及有机碎屑，它在消解碳系、氮系等有机污染时，也可消解有机污泥。嗜烃菌可短时间去除大部分油污，使其转化为二氧化碳和菌体蛋白。光合细菌能够利用水中残留的有机物作为氢的供体进行光合作用，减少分解水中的有害物质，起到改善水质,相对提高溶解氧的作用。鱼池中只要有5克／平方米的光合细菌，3小时内就能将池底不断产生的氮离子和有机物的初始分解物除去，使水质恢复正常。
