据国际锦鲤界相关资料介绍，锦鲤的分类，根据鳞片的差异可分为两大类，即普通鳞片型和无鳞型或少鳞型，无鳞的草鲤和少鳞的镜鲤是从德国引进的，所以常叫做德国系统锦鲤。按其斑纹的颜色即可分为三大类，即单色类如浅黄、黄金、变种鲤等；双色类如红白、写鲤、别光等；三色类如大正三色、昭和三色、衣等。
现在，全日本的“爱鳞会”则采用13种的分类法：红白、大正三色、昭和三色、写鲤、别光、浅黄秋翠、衣、变种鲤、黄金、花纹皮光鲤、写光鲤、金银鳞、丹顶。
1、红白锦鲤
红白锦鲤的底色为白上衬红色斑纹，是日本锦鲤的正统，有“绐于红白，终于红白”的美称。红白锦鲤中最可贵的品种是白色中绯红色要在眼部之上；其次是嘴部，没有绯红色而只是白色的是上等鱼。根据其背部斑纹的数量、形状和部位可分为如下品种：
(1)二段红白锦鲤在洁白的鱼体上，有2段绯红色的斑纹，宛如红色的晚霞，鲜艳夺目。躯干部的红斑，要左右对称才算佳品。
(2)三段红白锦鲤在洁白的鱼体背部生有3段红色的斑纹，非常醒目。
(3)四段红白锦鲤在银白色的鱼体上散布着4块鲜艳的红斑。
(4)一条红锦鲤从头部到尾柄有一红色的条带。
(5)闪电纹红白锦鲤鱼体上从头至尾有一红色斑纹，此斑纹形状恰似雷雨天的闪电光弯弯曲曲，因此而得名。
(6)富士红白锦鲤在头上有银白色的粒状斑点，就像是富士山顶的积雪。但是此斑点一般只出现在1龄或2龄的鱼体上。
(7)御殿樱锦鲤小粒红斑聚集成葡萄状的花纹，均匀地分布在鱼体背部两侧。
(8)金樱锦鲤御殿樱锦鲤红色鲜艳的鳞片边缘嵌有金色的线，称为金樱锦鲤。此是名贵品种，外表非常美丽。
2、大正三色锦鲤
大正三色锦鲤产生于1915年日本大正时代。其主要特点是在鱼体的纯白底色上布红色和黑色斑纹。这种鱼，最好的是黑色部分如墨一样黑，背侧有大的绯红色斑纹和黑色斑纹和谐地排列。所有的颜色必须显现在背部上方才算正品。大正三色锦鲤有的以斑纹新奇的色彩而制胜；有的却以姿态优雅、体形丰满、格调奇特而引入注目。根据其鱼体上红、黑色斑的分布可分为：
(1)口红三色锦鲤在鱼的嘴唇上生有圆形的鲜艳小红斑，极为俊俏。
(2)赤三色锦鲤指从头至尾柄有连续红斑纹的大正三色锦鲤。
(3)富士三色锦鲤在鱼体雪白的底色上，除有红、黑两种斑纹以外，头部出现银白色粒状斑纹。
(4)德国三色锦鲤以锦鲤为基本型，鱼体无鳞，在白色皮肤上，赫然呈现出红、黑斑纹。幼鱼时期鱼体尤为华丽。
3、昭和三色锦鲤
昭和三色锦鲤产生于1927年日本昭和年代。其主要特点是鱼体的黑色底色上有红、白花纹点缀，胸鳍基部有圆形黑斑，又称元黑。昭和三色锦鲤具有较高的观赏价值，华丽而矫健，是锦理中的精华。其主要品种有：
(1)淡黑昭和锦鲤在其黑斑上，所有的鳞片呈浅黑色，淡雅优美，别具风采。
(2)绯昭和锦鲤从头部至尾部，有大面积的红色花纹，红黑相同，艳丽而庄重。
(3)近代昭和锦鲤鱼体仍由黑、红、白三色组成，但是白色斑纹居多，黑纹犹如黑点白宣，具有大正三色锦鲤的鲜明色彩。
(4)德国昭和锦鲤以镜鲤为基本型。德国鲁鱼体披上昭和三色锦鲤的彩衣，花纹鲜明。
4、写鲤
写鲤的体色是以黑色为基底，上面有三角形的白斑纹或黄斑纹或红斑纹。其品种有：
(1)白写锦鲤：其三角形斑纹呈白色。此鱼黑白分明。
(2)黄写锦鲤：其黄斑纹金黄而有光泽。
(3)绯写锦鲤：其三角形斑纹呈橙红色，胸鳍也有红色斑纹。
5、别光锦鲤
在洁白、绯红、金黄的不同底色上呈现出黑斑的锦鲤，称为别光锦鲤。其品种有：
(1)白别光锦鲤鱼体的底色洁白，其上的黑斑纯黑，色浓，分布于躯干部和尾柄部，黑白相同，色彩极为明快清秀。
(2)赤别光锦鲤鱼体底色为红色，背部有黑斑纹。
