1、统合作用
所有机构和所有活动及其具体环节，由点到线、由线到面、逐级结合、统驭整体。在一个经营单位中，虽有不同的作业单位，但要达到经营目标，必须全面配合，以发挥整体作用。内控正是基于这种指导思想，利用会计、统计、业务、审计等部门的制度、规定及有关信息报告等作为基本依据，以实现统合与控制的双重目的。也就是说，内控应该把单位的生产、营销、物资、计划、财务、人事等部门及其工作结合在一起，同时又对它们进行必要的控制。各部门的业务虽有单独的系统，但其个别作业与整体业务是相联系的，必然要受其他部门作业的牵制和监督。因此，内控具有统合整体的作用。
2、约束与激励作用
内控着眼于各项业务的执行是否符合单位利益及既定的规范标准，而予以督查评价及适当的控制，使单位的各项经营活动做到活而有序，获得预期效果。由此可见，内控对管理活动能发挥制约作用;严密的监督与考核，能真实地反映工作实际，并可以稳定员工的工作情绪，激发他们的工作热情及潜能，从而提高工作效率。
内控的根本目的是实现既定目标。因此，要对执行过程中的影响因素造成的偏差进行调节，并控制具体影响因素的发生。l0m_47c本着这一原理，内控设计了约束机制和防范措施。执行者必须依据单位的既定计划或政策目标，按照一定的规律，对其全部活动加以注意，了解其职能与各部门之间的相互关系，并对其各项业务进行公正的检查和合理的评估。换句话说，就是要了解业务部门的实际工作动态，及时发挥控制的影响力，使之扬长避短，如期达到管理目标。因此，内控具有促进作用。
3、反馈与监督作用
反馈指系统输出信息返回输入端，经处理，再对系统输出施加影响的过程。内控利用反馈原理，通过会计信息的传递，对经营过程正确反映并对控制目标的完成和各部分行为是否偏离内控的要求进行监督，从而及时调整不利的行为。
4、完善治理结构
公司治理结构作为内控环境要素的构成内容之一，对内控的建立与执行有影响作用，反过来，有效的内控对公司治理结构的完善同样具有促进作用。有效的内控能够正确处理企业的利益相关者之间的关系。
