1、3%增值税普通发票是不能抵扣发票，而11%增值税专用发票是可以抵扣发票。
如果需方只需要3%增值税普通发票，而供方开的是11%增值税专用发票，需方如果不是一般纳税人，照样是无法抵扣的，但供方要承担的是11%税费，通常能开11%增值税专用发票的企业，其自身都是进项票可以抵扣的。
而多承担的税费，需方是不会额外承担的，只能由供方承担，所以在签订合同的时候要把税费谈清楚。
2、可以看营业执照经营范围中是否符合简易征收3%的条件，如果符合，可以到税务局申请单项开3%税率发票。
附：根据《财政部国家税务总局关于全面推开营业税改征增值税试点的通知》财税〔2016〕36号附件2规定：
（1）一般纳税人以清包工方式提供的建筑服务，可以选择适用简易计税方法计税。以清包工方式提供建筑服务，是指施工方不采购建筑工程所需的材料或只采购辅助材料，并收取人工费、管理费或者其他费用的建筑服务。
（2）一般纳税人为甲供工程提供的建筑服务，可以选择适用简易计税方法计税。甲供工程，是指全部或部分设备、材料、动力由工程发包方自行采购的建筑工程。
（3）一般纳税人为建筑工程老项目提供的建筑服务，可以选择适用简易计税方法计税。
拓展资料：
营改增后，建筑业的适用税率由营业税的3%改为增值税的11%。小规模纳税人提供建筑服务可选择简易计税方法，即按3%的税率征收，其中建筑材料采购费用支出、购进建筑机械设备的费用支出都可进行抵扣。企业如果科学地利用“政策”，做好应对，减税的空间也不小。
参考资料：
