进账与收入是两个概念。
进账是资金流，借贷、投资、销售收入（或营业收入）都会形成资金流，但是资金流并不是应税收入。只有发生应税收入的时候才申报纳税。没有应税收入的企业可以零报税。
应税收入：生产、经营、服务收入，是指纳税人的商品（产品）销售收入、劳务服务收入、营业收入、工程价款结算收入、工业性作业收入以及其他业务收入。
如果是公司账户有货款进入的话，一般是需要给对方开票的，就必然涉及到交税问题，如果收入了货款而不开票的话，税务部门查账的时候会查出涉嫌逃税的问题。所以，按公司账户收到的货款金额作为纳税依据。
