国税局的小产权房同样也属于小产权房，由于小产权房本身不合法，因而购买小产权房会具备一定的风险。
一、缺少“五证”
“五证”是消费者取得房产证的先决条件，即具备国有土地使用证、建设用地规划许可证、建设工程规划许可证、建筑工程施工许可证及商品房销预售许可证。包括城中村改造在内的房地产项目，如果没有“五证”是不能办理房产证的。“小产权房”存在诸多风险，最大的问题就是没有产权，不受法律的保护。
二、拆迁难补偿
除了不能办理房产证外，那些“便宜房”实际上属于在政府规定范围以外的违章建筑，如果和国家的规划相冲突，还很有可能被拆除，而且业主也不会得到拆迁安置补偿。
三、质量难保证
房屋质量没人监督，一些开发商为赚钱会偷工减料，存在安全隐患。这类房屋一般由土地所在村开发，除了房屋质量和房屋售后保修难以保证以外，入住后的物业管理也极容易出现问题。
四、配套不完善
这些房子几乎都没有暖气、天然气等配套设施。而且将来一旦出现纠纷，可能连水电都没有。
五、遗赠也麻烦
由于缺乏产权，未来在遗产继承时也会遇到许多麻烦。借新农村建设、旧村改造名义，是“小产权房”目前普遍的运作模式，具有打擦边球的性质。一旦清盘，兑现不了承诺马上撤离，后续引发的许多麻烦都甩给购房者。
六、小产权房不能抵押或者上市转卖。
