1、相关规定不同
按照中央编委有关规定，国务院批准的较大的市和副省部级以上单位的秘书机构才能称为“办公厅”，办公厅是党政机关设立的负责协助机关机关日常工作和机关行政管理事务的综合职能部门。
普通的地级市、县级市的市委部门的秘书机构称为“办公室”。办公室是一个单位对外的窗口，对内协助领导工作的机关，如区政府办公室、党校办公室等。
2、行政级别不同
副省部级以上单位才能称为“办公厅”，厅局级机构；地厅级以下单位只能称为“办公室”，处、科级机构。省会城市可以高配级别。计划单列市享受副省级待遇。
3、隶属机构不同
省部级单位的办公厅为正厅级单位，如中共北京市市委办公厅、北京市人民政府办公厅、中共河北省省委办公厅、湖南省人民政府办公厅、中华人民共和国铁道部办公厅等。“市委办公厅”属于厅局级机构，例如，长春市委办公厅、济南市委办公厅。而“市委办公室”属于处、科级机构，例如，铜陵市委办公室、周口市委办公室。
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